Les collections sont tout d'abord présentées au sein du Musée d'histoire naturelle de Strasbourg. Elles sont alors mises à disposition de l'enseignement universitaire. L'essentiel des objets est exposés en vitrine ou accroché aux murs.
Les collections seront par la suite présentées dans un Musée de Paléontologie - aujourd'hui disparu - qui occupait la moitié du 2ème étage de l'Insitut de Géologie, dès 1890. Ce deuxième étage est celui occupé à l'époque par l'Institut de Paléontologie, créé en 1873, et le musée était alors accessible chaque jour aux visiteurs.
La réorganisation des espaces au sein du bâtiment au fil du temps et la diversification des activités géologiques de l'Institut mèneront à la suppression de ce musée. Depuis 1978, c'est une salle d'exposition qui tient ce rôle de vitrine des collections. Elle est installée au sous-sol du bâtiment - dans une ancienne cour intérieure réaménagée - et permet l'accueil des visisteurs dans un lieu spacieux et modulable.
Depuis 2023, cet espace est accessible au public chaque mercredi.